לוחות הזמנים של רכבת ברנינה מתעדכנים אחת לשנה בחודש דצמבר, אך בפועל הם עוברים התאמות קלות לאורך העונות בהתאם לתנאי מזג האוויר ולביקוש. לכן, מומלץ לעיין בלוח הזמנים הרשמי לפחות שבועיים לפני הנסיעה, ובמיוחד אם נוסעים בחורף. בתקופות של עומס תיירות, כמו יולי-אוגוסט ודצמבר-ינואר, השינויים בלו״ז יכולים להתרחש גם בטווח של ימים ספורים בלבד. במקרים שבהם מתוכננות עבודות תחזוקה במסילה, החברה לעיתים משחררת עדכון מיוחד היכול להשפיע על שעת היציאה, על משך הנסיעה או על מספר הרכבות הפועלות באותו יום. בדיקה מראש מבטיחה הפתעה מינימלית והיערכות נכונה יותר למסלול.

במקרים נדירים בלבד הרכבת מתבטלת לחלוטין, אך עיכובים ושינויים בשעת היציאה הם תופעה אפשרית – בעיקר בחורף. במספר מקטעים לאורך המעבר של ברנינה פס (Bernina Pass), גובה השלג עשוי להשפיע על קווי החשמל העיליים ועל זמני פינוי המסילה. כאשר השלג מגיע לגובה קריטי, צוותי תחזוקה פועלים לפני יציאת הרכבת כדי לוודא שהמסלול בטוח. לעיתים פעולה זו מחייבת דחייה של יציאה מתוכננת. בקיץ, לעומת זאת, רק אירועים חריגים כמו מפולות סלעים או עבודות חירום מהווים סיבה לשינויים בלו״ז.

כן. בתקופות שיא התיירות, בעיקר באוגוסט, החברה מפעילה רכבות חיזוק שאינן מוגדרות רשמית כקרונות פנורמיים, אך הן מאפשרות להגדיל את נפח הנוסעים. למרות זאת, מספר הרכבות הפנורמיות אינו משתנה בצורה חופשית, משום שהמסילה מוגבלת מבחינת קיבולת. כאשר הביקוש גבוה במיוחד, החברה מעדיפה לתזמן רכבות בשעות מדויקות יותר כדי לאפשר מעבר חלק בין מקטעי המסילה הצרים ולהימנע מהצטברות רכבות במוקדי מעבר מרכזיים.

הסיבה העיקרית נעוצה בהתאמות תחזוקה הנדרשות בצד אחד של המסילה. לעיתים פינוי שלג בצד אחד של המעבר לוקח זמן רב יותר, ולכן הרכבת בצד זה יוצאת מעט מאוחר או בתדירות מצומצמת יותר. בנוסף, חלק מהתיירים מבצעים מסלול חד־כיווני בלבד ומשלבים בהמשך אוטובוס או רכבת ליעד אחר, מה שמשפיע על מאזן הביקוש בכל כיוון ויוצר תדירות שונה בשני הצדדים של המסלול.

לאורך כל ימות השנה פועלות רכבות מקומיות של RhB הנוסעות באותו מסלול בין טיראנו לסנט מוריץ. אלו אינן בעלות חלונות פנורמיים כמו ברנינה אקספרס, אך הן מציעות חוויה דומה מבחינת הנופים והתחנות. רכבות אלו נחשבות גמישות יותר מבחינת לו״ז, ובדרך כלל יש להן תדירות גבוהה מזו של הרכבת הפנורמית הרשמית. הן מהוות פתרון מצוין בימים שבהם אין מקומות פנויים, או כאשר רוצים לנסוע בשעות אחרות שאינן תואמות לרכבות ברנינה.

באופן מפתיע – כן. החברה מתחשבת בזוויות צילום ובאיכות התאורה בנקודות מפתח כמו גשר לנדווסר (Landwasser Viaduct). בעונת הקיץ, כאשר שעות האור ארוכות, הלו״ז מותאם כך שהרכבת עוברת במקטעים מסוימים בזמנים שבהם התאורה אידיאלית עבור צלמים. בעונות מעבר הלו״ז נבנה לפי חלונות תאורה קצרים יותר, מה שמגביל את מספר הרכבות האפשריות.

בשעות הבוקר המוקדמות ובשעות אחר הצהריים המאוחרות קיימים לעיתים ערפילים באזורים גבוהים כמו אוזפיץ (Ospizio Bernina). לעומת זאת, שעות הצהריים בדרך כלל מציעות ראות טובה ויציבה יותר, במיוחד מעל אגם ביאנקו (Lago Bianco). בקיץ, הרכבת שמתחילה באמצע הבוקר נחשבת לרוב לאידיאלית, משום שהיא מספקת גם תאורה מצוינת בנקודות התצפית וגם מזג אוויר יציב. בחורף, יציאת הבוקר נחשבת לבטוחה יותר מבחינת רוחות ושלג.

בימי שבת ובחלק מימי ראשון בעונת הקיץ, קיימת נטייה להפעיל רכבת חיזוקית נוספת בהתאם לעומס. בימי חול, התדירות לרוב קבועה וללא שינוי. בעונות מעבר, בעיקר בסתיו, ימי שבת משמשים לבחינת השפעת עומס התיירות על התאמת הלו״ז לשנה הבאה. לכן לעיתים נצפה שינוי נקודתי המופיע רק בסופי השבוע.

משך הנסיעה המקורי עומד על כשעתיים ורבע עד שעתיים וחצי, אך בפועל בחורף יתכנו הארכות קלות של 5-12 דקות בגלל מזג אוויר ואתגרי פינוי שלג. משך הנסיעה עצמו אינו משתנה בצורה משמעותית לאורך השנה, אך זמני העצירה בתחנות מסוימות מתכווצים או מתארכים על פי תנאי שטח, מה שעשוי להשפיע במעט על שעת ההגעה לתחנה הסופית.

הדיוק נחשב גבוה מאוד יחסית למסילות הרריות. רוב הרכבות יוצאות תוך טווח של שתיים עד שלוש דקות מהשעה הרשמית. הסטייה המשמעותית מתרחשת בעיקר בעקבות אירועי מזג אוויר או עומסים לא צפויים במסילה. מערכת התזמון ההררית דואגת למרווחי ביטחון בין רכבת אחת לשנייה, ולכן הלו״ז נשמר בקפדנות כדי למנוע הצטלבויות בעייתיות במסילות הפיקוד.

כן. נסיעות מוקדמות בבוקר נוטות להיות שקטות יותר, גם בעונת הקיץ. נסיעות הצהריים הן המבוקשות ביותר ורמת העומס בהן גבוהה, מה שיכול להשפיע על אווירת הקרון. בחורף, לעומת זאת, נסיעות הצהריים הן העדיפות, הן מבחינת תאורה והן מבחינת יציבות מזג האוויר. לוחות הזמנים תוכננו כך שיתאימו לדפוסי התיירות, אך העומס משתנה בהתאם לשעה.